Popis předmětu - BEAM31MOA
| BEAM31MOA | Modeling and analysis of brain activity | ||
|---|---|---|---|
| Role: | PS, PV | Rozsah výuky: | 2P+2C |
| Katedra: | 13131 | Jazyk výuky: | EN |
| Garanti: | Zakončení: | Z,ZK | |
| Přednášející: | Kreditů: | 6 | |
| Cvičící: | Semestr: | Z | |
Anotace:
Tento předmět pokrývá základní metody modelování a analýzy mozkové aktivity. Po zavedení/zopakování základních pojmů dynamických systémů budou studovány příklady generativních modelů mozkové aktivity, napříč úrovním od modelů dynamiky na membráně neuronu po aktivu neurálních populací a jejich interakci. V druhé části kurzu se budeme věnovat metodám analýzy a statistického modelování mozkové aktivity od základních metod analýzy funkční a efektivní konektivity mozku až po pokročilé partie grafové analýzy struktury mozkových sítí.Osnovy přednášek:
| 1. | Úvod do tématu, motivační příklady. | |
| 2. | Lineární autoregresní model a jeho uplatnění v modelování mozkové aktivity, specifika nelineárních modelů. | |
| 3. | Přehled typů modelů mozkové aktivity. | |
| 4. | FitzHugh-Nagumův model. | |
| 5. | Populační modely: Wilsonův-Cowanův model. | |
| 6. | Modelování sítí neuronů/populací. | |
| 7. | Modelování neurozobrazovacích signálů (EEG/fMRI). | |
| 8. | Funkční a efektivní konektivita: definice, přehled metod. | |
| 9. | Funkční a efektivní konektivita: pokročilé metody, výběr metod. | |
| 10. | Specifika statistického testování v neurozobrazování: multiple testing correction, náhradní modely. | |
| 11. | Grafově-teoretická analýza sítí. | |
| 12. | Problémy interpretace grafově-teoretické analýzy sítí. | |
| 13. | Závěrečné shrnutí. | |
| 14. | Prezentace výsledků projektové práce. |
Osnovy cvičení:
Literatura:
Jirsa, V. & McIntosh, A. (Eds.). Handbook of Brain Connectivity. Springer, 2007 Hoppensteadt, F. C. & Izhikevich, E. M. Weakly connected neural networks. Springer-Verlag New York, 1997 Kantz, H. & Schreiber, T. Nonlinear time series analysis. Cambridge university press, 2004, 7 Ermentrout, B. Simulating, Analyzing, and Animating Dynamical Systems: A Guide To Xppaut for Researchers and Students. Society for Industrial and Applied Mathematics, 2002Požadavky:
Předmět je zahrnut do těchto studijních plánů:
| Plán | Obor | Role | Dop. semestr |
| MEBIO1_2018 | Bioinformatics | PV | 3 |
| MEBIO4_2018 | Signal Processing | PS | 3 |
| MEBIO2_2018 | Medical Instrumentation | PV | 3 |
| MEBIO3_2018 | Image Processing | PV | 3 |
| Stránka vytvořena 19.2.2026 09:50:56, semestry: L/2027-8, Z,L/2026-7, L/2025-6, Z/2027-8, připomínky k informační náplni zasílejte správci studijních plánů | Návrh a realizace: I. Halaška (K336), J. Novák (K336) |